皇历2010年，超级大国·神圣不列颠尼亚帝国为了夺取日本的地下资源而侵略日本。在欧洲帝国强大的拟人兵器Knightmare进攻下，日本在不到一个月的时间内被征服，被剥夺了自由、权利甚至是国家的名字，神圣不列颠帝国将“日本”改称为“11区”，“日本人”这名词则被11这数字所取代。表面上看来帝国的贵贱阶级统治似乎牢不可破，但其中早已出现了裂痕。

七年后的2017年，在生死边缘获得“Geass”的力量，立志要粉碎神圣不列颠帝国的黑色皇子鲁鲁修，最终影响了整个世界

鲁路修本是帝国的王子，在母后遇害后，和失明的妹妹一起被流放到11区（原日本国）作为人质。在那里他们结识了日本王子朱雀，三人共同度过一段美好的童年时光。帝国最终全面攻陷了11区，鲁路修和妹妹的安宁生活再次被剥夺，朱雀和他们也分散了。 鲁路修和妹妹隐瞒身份，过着看似平凡的学生生活。然而鲁路修心中对于帝国的仇恨却未停止。他希望摧毁帝国，为妹妹营造一个可以快乐生活的世界。这一切随着神秘少女C.C的出现变得不再遥不可及。 此时朱雀也再次出现在他们的生活中，然而残酷的现实让童年的挚友难以重温童年往事。这里没有正义和邪恶，黑暗与光明，有的仅仅是艰难的抉择和难以预料的明天。